Те же молекулы, но нарисованные объёмом: каждая сфера — один аминокислотный остаток или нуклеотид, как в space-filling представлении. Оформление под шаблон Berkeley и IGI, чтобы кадры ложились прямо в презентацию. Каждую сцену можно повернуть, приблизить и сохранить в PNG.
Белок держит расплетённый участок: направляющая РНК спарена с целевой цепью, вторая цепь вытеснена наружу. Это тот же кадр, что на титульном слайде шаблона, только здесь его можно покрутить.
Тяните, чтобы повернуть. Колесо, ползунок, кнопки или клавиши + и − — чтобы приблизить.
Четыре части одной молекулы, каждая своим цветом, на гибких линкерах вокруг dCas9. Относительные объёмы соответствуют молекулярным массам доменов.
Момент реакции: целевое основание вышло из спирали в карман фермента, рядом кофактор. DNMT3L каталитически неактивен, но держится за DNMT3A и повышает его активность.
Объёмы доменов посчитаны из молекулярных масс, шаг и диаметр ДНК взяты из параметров B-формы, число сфер отвечает числу остатков. Форма поверхности — приближение: это не свёрнутая по-настоящему цепь и не экспериментальные координаты. Для настоящей геометрии смотрите PDB 4OO8 для Cas9 и 2QRV для DNMT3A с DNMT3L.