Четыре анимации: как метка ставится, как переживает деление клетки, как метилирование теряется в клетках вообще и что известно про его потерю после CRISPRoff. Каждый шаг подписан, источники — внизу страницы.
Порядок доменов по вашей схеме. Ширина блоков примерно пропорциональна длине в аминокислотах — точные границы конструкта зависят от плазмиды, так что это приближение.
От посадки на ДНК до появления 5-метилцитозина. Химия реакции показана по шагам — именно так работают все C5-метилтрансферазы.
Репликация делает из симметрично метилированного CpG полуметилированный. Дальше его должна распознать система поддержания.
Два пути. Пассивный — разбавление при делениях. Активный — окисление TET и вырезание через репарацию. В большинстве соматических контекстов преобладает пассивный.
Редактор транзиентный: через несколько дней его уже нет, и дальше судьбу метки решает только точность поддержания. Последний кадр — наши собственные данные, и они показывают обратное потере.
Разбавление метки — это общая модель того, как эпигенетическая память может теряться. В нашем эксперименте на CD55 в T-клетках между Day 6 и Day 35 метилирование не падало, а росло: средняя Δ выросла на 133 из 137 CpG, профили коррелируют r = 0.943. То есть за этот промежуток мы наблюдали закрепление, а не потерю. Оговорка прежняя: Day 6 и Day 35 — разные доноры, поэтому строго это две точки, а не кинетика.
Сам KRAB — маленький домен без ферментативной активности. Он работает как посадочная площадка: связывает KAP1 (он же TRIM28), а тот уже собирает на себе всю репрессивную машину.
| Партнёр | Что делает | Как попадает в комплекс |
|---|
Всё, на чём построены схемы выше. Анимации — это упрощённые модели по этим работам, а не воспроизведение конкретных рисунков.